Here is a list of all documented functions with links to the documentation:

- a -

• Addrc() : coord.h, coord.c
• Average_Plaquette() : su2hmc.h, bosonic.c

- c -

• C_gather() : su2hmc.h, su2hmc.c
• CHalo_swap_all() : par_mpi.h
• CHalo_swap_dir() : par_mpi.h
• Check_addr() : coord.h, coord.c
• Congradp() : su2hmc.h, congrad.c
• Congradq() : su2hmc.h, congrad.c
• Coord2gindex() : coord.h, coord.c
• Coord2lindex() : coord.h, coord.c

- d -

• DHalo_swap_all() : par_mpi.h
• DHalo_swap_dir() : par_mpi.h
• Dslash() : matrices.h, matrices.c
• Dslash_f() : matrices.h, matrices.c
• Dslashd() : matrices.h, matrices.c
• Dslashd_f() : matrices.h, matrices.c

- f -

• Fill_Small_Phi() : su2hmc.h, su2hmc.c
• Force() : su2hmc.h, force.c

- g -

• Gauge_force() : su2hmc.h, force.c
• Gauge_Update() : integrate.h
• Gauss_c() : random.h, random.c
• Gauss_d() : random.h, random.c
• Gauss_f() : random.h, random.c
• Gauss_z() : random.h, random.c

- h -

• Hamilton() : su2hmc.h, su2hmc.c
• Hdslash() : matrices.h, matrices.c
• Hdslash_f() : matrices.h, matrices.c
• Hdslashd() : matrices.h, matrices.c
• Hdslashd_f() : matrices.h, matrices.c

- i -

• ia() : coord.h, coord.c
• Index2gcoord() : coord.h, coord.c
• Index2lcoord() : coord.h, coord.c
• Init() : su2hmc.h, su2hmc.c

- l -

• Leapfrog() : integrate.h

- m -

• main() : main.c
• Measure() : su2hmc.h, fermionic.c
• Momentum_Update() : integrate.h

- o -

• OMF2() : integrate.h
• OMF4() : integrate.h

- p -

• Par_begin() : par_mpi.h, par_mpi.c
• Par_ccopy() : par_mpi.h
• Par_csum() : par_mpi.h
• Par_dcopy() : par_mpi.h
• Par_dsum() : par_mpi.h
• Par_fcopy() : par_mpi.h
• Par_fsum() : par_mpi.h
• Par_granf() : random.h, random.c
• Par_icopy() : par_mpi.h
• Par_isum() : par_mpi.h
• Par_ranread() : random.h, random.c
• Par_ranset() : random.h, random.c
• Par_sread() : par_mpi.h, par_mpi.c
• Par_swrite() : par_mpi.h, par_mpi.c
• Par_zcopy() : par_mpi.h
• Par_zsum() : par_mpi.h
• Polyakov() : su2hmc.h, bosonic.c

- r -

• ran2() : random.h, random.c
• ran_test() : random.h
• ranset() : random.h, random.c
• Reunitarise() : su2hmc.h, matrices.c

- s -

• SU2plaq() : su2hmc.h, bosonic.c

- t -

• Testgcoord() : coord.h, coord.c
• Testlcoord() : coord.h, coord.c
• Trial_Exchange() : par_mpi.h, par_mpi.c

- z -

• Z_gather() : su2hmc.h, su2hmc.c
• ZHalo_swap_all() : par_mpi.h
• ZHalo_swap_dir() : par_mpi.h